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Crystal Structure of Clone42 TCR
Item | Info |
---|---|
PDB | 4g8f |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ9 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSPRLAGDEQF | None | 12 |
CDRB2 | SVGEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVRNTGGFKTI | None | 11 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.37° |
BC1 | 71.74° |
BA | -62.87° |
AC2 | 78.56° |
AC1 | 124.53° |
dc | 16.77Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3tf7_Ii | 107.15° | 71.55° | -61.98° | 78.65° | 125.58° | 17.03Å | 1.6 |
8i5c_ON | 106.07° | 73.01° | -62.27° | 78.18° | 123.80° | 16.59Å | 1.7 |
8i5c_JI | 105.80° | 73.04° | -62.22° | 78.09° | 123.79° | 16.56Å | 1.8 |
8i5c_TS | 106.08° | 73.18° | -62.04° | 77.86° | 123.65° | 16.53Å | 2.0 |
4pj7_FE | 104.93° | 73.02° | -62.94° | 79.01° | 123.61° | 16.69Å | 2.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 5.6 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 6.2 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.4 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.5 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 6.6 |