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Protein complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 4gg6 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.2Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ45 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | I |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | QQYPSGEGSFQPSQENPQ |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | E | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSVAVSAGTYEQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDGRGGADGLT | None | 13 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 111.17° |
BC1 | 73.07° |
BA | -62.86° |
AC2 | 89.77° |
AC1 | 131.55° |
dc | 16.94Å |
Docking angle | 41.92° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3dxa_JI | 112.22° | 71.85° | -61.83° | 88.91° | 130.24° | 18.26Å | 2.8 |
3dxa_ED | 112.24° | 72.38° | -62.37° | 87.77° | 130.29° | 18.02Å | 2.9 |
3dxa_ON | 112.06° | 72.11° | -62.92° | 87.81° | 130.26° | 18.12Å | 2.9 |
1mi5_ED | 109.30° | 72.73° | -63.43° | 87.70° | 131.17° | 17.09Å | 2.9 |
4z7v_HG | 111.21° | 73.03° | -62.36° | 92.92° | 131.88° | 17.12Å | 3.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4jpw_HL | 112.65° | 71.66° | -58.66° | 89.39° | 123.36° | 16.92Å | 9.4 |
4xvs_HL | 115.53° | 75.40° | -59.24° | 84.30° | 126.77° | 16.08Å | 9.5 |
2w65_CD | 112.47° | 72.16° | -61.11° | 84.03° | 123.78° | 16.59Å | 10.0 |
4s1q_HL | 115.45° | 75.99° | -60.47° | 82.99° | 127.28° | 15.31Å | 10.0 |
Item | Info |
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VB chain | H |
VA chain | G |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ45 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | J |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | QQYPSGEGSFQPSQENPQ |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | H | FASTA file |
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VA | G | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSVAVSAGTYEQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDGRGGADGLT | None | 13 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 110.99° |
BC1 | 73.29° |
BA | -63.02° |
AC2 | 90.06° |
AC1 | 131.30° |
dc | 16.97Å |
Docking angle | 39.30° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3dxa_JI | 112.22° | 71.85° | -61.83° | 88.91° | 130.24° | 18.26Å | 3.0 |
4z7v_HG | 111.21° | 73.03° | -62.36° | 92.92° | 131.88° | 17.12Å | 3.0 |
1mi5_ED | 109.30° | 72.73° | -63.43° | 87.70° | 131.17° | 17.09Å | 3.0 |
3dxa_ED | 112.24° | 72.38° | -62.37° | 87.77° | 130.29° | 18.02Å | 3.2 |
3dxa_ON | 112.06° | 72.11° | -62.92° | 87.81° | 130.26° | 18.12Å | 3.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4jpw_HL | 112.65° | 71.66° | -58.66° | 89.39° | 123.36° | 16.92Å | 9.4 |
4xvs_HL | 115.53° | 75.40° | -59.24° | 84.30° | 126.77° | 16.08Å | 9.7 |