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Immune Receptor
Item | Info |
---|---|
PDB | 4gg8 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.2Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ45 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSVAVSAGTYEQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDGRGGADGLT | None | 13 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 107.54° |
BC1 | 70.62° |
BA | -50.55° |
AC2 | 94.37° |
AC1 | 132.63° |
dc | 17.48Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7dzm_DE | 104.92° | 71.39° | -51.44° | 93.90° | 130.79° | 17.55Å | 3.4 |
7dzn_DE | 104.31° | 71.30° | -51.03° | 94.04° | 131.03° | 17.63Å | 3.7 |
8vd0_ED | 108.62° | 70.83° | -54.02° | 95.19° | 131.05° | 17.35Å | 4.1 |
8vd0_JI | 108.28° | 71.33° | -55.14° | 93.60° | 129.38° | 17.32Å | 5.8 |
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 6.2 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ45 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | E | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSVAVSAGTYEQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDGRGGADGLT | None | 13 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 107.56° |
BC1 | 70.66° |
BA | -50.66° |
AC2 | 94.18° |
AC1 | 132.57° |
dc | 17.45Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7dzm_DE | 104.92° | 71.39° | -51.44° | 93.90° | 130.79° | 17.55Å | 3.4 |
7dzn_DE | 104.31° | 71.30° | -51.03° | 94.04° | 131.03° | 17.63Å | 3.7 |
8vd0_ED | 108.62° | 70.83° | -54.02° | 95.19° | 131.05° | 17.35Å | 4.0 |
8vd0_JI | 108.28° | 71.33° | -55.14° | 93.60° | 129.38° | 17.32Å | 5.6 |
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 6.0 |