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Ha1.7, a MHC Class Ii Restricted TCR Specific For Haemagglutinin
Item | Info |
---|---|
PDB | 4gkz |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.39Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV28/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV8/TRAJ48 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSSTGLPYGYT | None | 12 |
CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
CDRA3 | AVSESPFGNEKLT | A3-13-E | 13 |
CDRA2 | YTSAATLV | A2-8-C | 8 |
CDRA1 | SSVPPY | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 105.05° |
BC1 | 75.56° |
BA | -58.82° |
AC2 | 71.13° |
AC1 | 122.89° |
dc | 16.12Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6fr7_BA | 105.14° | 75.84° | -58.95° | 71.38° | 122.35° | 16.21Å | 0.7 |
6fr8_BA | 104.97° | 75.89° | -58.54° | 71.89° | 123.22° | 16.26Å | 0.9 |
6eh8_BA | 104.71° | 75.21° | -59.36° | 71.27° | 124.05° | 16.26Å | 1.4 |
6fr6_BA | 105.42° | 75.28° | -58.35° | 72.29° | 123.61° | 16.47Å | 1.6 |
6eh9_BA | 103.54° | 75.41° | -59.14° | 72.58° | 122.83° | 16.08Å | 2.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.9 |