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Crystal Structure of a Human Mait TCR in complex with Bovine Mr1
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4iiq |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.86Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Protein |
| Antigen Organism | BOS TAURUS |
| Antigen Sequence | IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDLGGGGSGGSGSGGGGSRTHSLRYFRLGISEPGYGIPEFISAGYVDSHPITMYNSVSQLXEPRALWMEENLAPDHWERYTQLLRGWQQAFKVELKQLQHHYNHSGFHTYQRMIGCELLEDGSITGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWMAMDNVADIIRRVWEANRHELQYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDALQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGFQESETILGG |
| Antigen Length | 392 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSVWTGEGSGELF | None | 14 |
| CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
| CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
| CDRA3 | AVKDSNYQLI | None | 10 |
| CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
| CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 103.65° |
| BC1 | 73.89° |
| BA | -66.35° |
| AC2 | 79.44° |
| AC1 | 124.10° |
| dc | 16.42Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4lcc_BA | 104.44° | 73.52° | -65.60° | 79.10° | 124.33° | 16.60Å | 1.2 |
| 4l4v_ED | 103.99° | 73.92° | -64.98° | 79.27° | 123.23° | 16.55Å | 1.7 |
| 4nqc_HG | 104.20° | 73.73° | -64.82° | 79.49° | 123.27° | 16.53Å | 1.8 |
| 7ufj_FE | 104.18° | 74.00° | -65.53° | 78.41° | 123.06° | 16.52Å | 1.8 |
| 6puc_HG | 104.22° | 73.84° | -64.95° | 79.12° | 122.99° | 16.51Å | 1.9 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.1 |
| 4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.8 |
| 5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 7.0 |
| 1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.9 |
| 4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 8.1 |