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High affinity alpha24-Beta17 T Cell Receptor For a2 HLA-Melanoma Peptide complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 4jfh |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.4Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV30/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ5 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AWSETGLGMGGWQ | None | 13 |
CDRB2 | WGPFG | None | 5 |
CDRB1 | GTSNPN | None | 6 |
CDRA3 | AVNDGGRLT | None | 9 |
CDRA2 | TYREGD | None | 6 |
CDRA1 | FLGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.12° |
BC1 | 72.76° |
BA | -55.04° |
AC2 | 82.61° |
AC1 | 121.25° |
dc | 15.95Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6mss_BA | 101.09° | 73.12° | -55.20° | 81.96° | 121.34° | 16.03Å | 1.2 |
6mra_BA | 100.44° | 73.77° | -54.63° | 82.11° | 122.00° | 15.88Å | 1.5 |
3vxs_ED | 100.98° | 72.92° | -55.61° | 83.05° | 120.18° | 15.92Å | 1.6 |
7pdx_BA | 101.38° | 72.06° | -55.01° | 82.98° | 122.29° | 16.58Å | 1.9 |
8gvb_BA | 99.60° | 73.97° | -56.72° | 82.64° | 122.55° | 15.61Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.4 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.6 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.1 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 9.1 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.6 |