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Crystal Structure of a Human Valpha7.2/Vbeta13.3 Mait TCR in complex with Bovine Mr1
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4l8s |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.9Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Protein |
| Antigen Organism | BOS TAURUS |
| Antigen Sequence | IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDLGGGGSGGSGSGGGGSRTHSLRYFRLGISEPGYGIPEFISAGYVDSHPITMYNSVSQLXEPRALWMEENLAPDHWERYTQLLRGWQQAFKVELKQLQHHYNHSGFHTYQRMIGCELLEDGSITGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWMAMDNVADIIRRVWEANRHELQYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDALQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGFQESETILGG |
| Antigen Length | 392 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSETDPNTGELF | None | 13 |
| CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
| CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
| CDRA3 | ASMDSNYQLI | None | 10 |
| CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
| CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 104.35° |
| BC1 | 74.03° |
| BA | -64.51° |
| AC2 | 80.22° |
| AC1 | 124.30° |
| dc | 16.34Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6puh_GB | 104.13° | 73.84° | -64.63° | 79.40° | 123.23° | 16.51Å | 1.4 |
| 4nqc_HG | 104.20° | 73.73° | -64.82° | 79.49° | 123.27° | 16.53Å | 1.4 |
| 5jhd_JI | 104.08° | 74.11° | -63.27° | 80.34° | 123.75° | 16.12Å | 1.4 |
| 4pjg_FE | 104.74° | 74.03° | -63.43° | 80.23° | 123.23° | 16.55Å | 1.6 |
| 4l4v_ED | 103.99° | 73.92° | -64.98° | 79.27° | 123.23° | 16.55Å | 1.6 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 5.8 |
| 4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 5.9 |
| 1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.1 |
| 1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 7.2 |
| 1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 7.9 |