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Crystal Structure of a Human Valpha7.2/Vbeta13.3 Mait TCR in complex with Bovine Mr1
Item | Info |
---|---|
PDB | 4l8s |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.9Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Protein |
Antigen Organism | BOS TAURUS |
Antigen Sequence | IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDLGGGGSGGSGSGGGGSRTHSLRYFRLGISEPGYGIPEFISAGYVDSHPITMYNSVSQLXEPRALWMEENLAPDHWERYTQLLRGWQQAFKVELKQLQHHYNHSGFHTYQRMIGCELLEDGSITGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWMAMDNVADIIRRVWEANRHELQYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDALQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGFQESETILGG |
Antigen Length | 392 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSETDPNTGELF | None | 13 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
CDRA3 | ASMDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 104.35° |
BC1 | 74.03° |
BA | -64.51° |
AC2 | 80.22° |
AC1 | 124.30° |
dc | 16.34Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6puh_GB | 104.13° | 73.84° | -64.63° | 79.40° | 123.23° | 16.51Å | 1.4 |
4nqc_HG | 104.20° | 73.73° | -64.82° | 79.49° | 123.27° | 16.53Å | 1.4 |
5jhd_JI | 104.08° | 74.11° | -63.27° | 80.34° | 123.75° | 16.12Å | 1.4 |
4pjg_FE | 104.74° | 74.03° | -63.43° | 80.23° | 123.23° | 16.55Å | 1.6 |
4l4v_ED | 103.99° | 73.92° | -64.98° | 79.27° | 123.23° | 16.55Å | 1.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 5.8 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 5.9 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.1 |
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 7.2 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 7.9 |