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Crystal Structure of a Human Mait TCR in complex with a Bacterial antigen Bound to Humanized Bovine Mr1
Item | Info |
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PDB | 4lcc |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.263Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C | C |
Antigen Type | Protein |
Antigen Organism | BOS TAURUS |
Antigen Sequence | IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDLGGGGSGGSGSGGGGSRTHSLRYFRLGISEPGYGIPEFISAGYVDSHPITMYNSVSQLKEPRALWMEENLAPDHWERYTQLLRGWQQMFKVELKQLQHHYNHSGFHTYQRMIGCELLEDGSITGFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWMAMDNVADIIRRVWEANQHELLYQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDALQRTEPPKVRVNHKETFPGITTLYCRAYGFYPPEISINWMKNGEEIFQDTDYGGILPSGDGTYQTWVSVELDPQNGDIYSCHVEHGGVHMVLQGFQESETILGG |
Antigen Length | 392 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSVWTGEGSGELF | None | 14 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
CDRA3 | AVKDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 104.44° |
BC1 | 73.52° |
BA | -65.60° |
AC2 | 79.10° |
AC1 | 124.33° |
dc | 16.60Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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4iiq_BA | 103.65° | 73.89° | -66.35° | 79.44° | 124.10° | 16.42Å | 1.2 |
4nqc_HG | 104.20° | 73.73° | -64.82° | 79.49° | 123.27° | 16.53Å | 1.4 |
4l4v_ED | 103.99° | 73.92° | -64.98° | 79.27° | 123.23° | 16.55Å | 1.4 |
6puc_HG | 104.22° | 73.84° | -64.95° | 79.12° | 122.99° | 16.51Å | 1.5 |
4pje_HG | 103.55° | 73.09° | -65.11° | 78.38° | 123.58° | 16.64Å | 1.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.0 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.5 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 6.8 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.1 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.4 |