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Crystal Structure of Dn6 TCR
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4onh |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 3.008Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV36/TRAJ52 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASRHGLASYEQY | None | 12 |
| CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
| CDRB1 | MNHNY | None | 5 |
| CDRA3 | AWAGGTSYGKLT | None | 12 |
| CDRA2 | LTSSGIE | None | 7 |
| CDRA1 | VTNFRS | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 106.40° |
| BC1 | 71.96° |
| BA | -51.81° |
| AC2 | 87.71° |
| AC1 | 127.93° |
| dc | 17.28Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2cde_FE | 103.80° | 70.90° | -51.77° | 85.50° | 129.72° | 17.10Å | 4.0 |
| 3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 4.1 |
| 3dx9_DC | 103.97° | 70.05° | -51.49° | 90.65° | 128.47° | 17.29Å | 4.3 |
| 3vxu_ED | 106.29° | 69.31° | -49.40° | 85.23° | 125.93° | 17.29Å | 4.8 |
| 6rsy_JI | 103.21° | 72.00° | -53.93° | 91.18° | 125.77° | 16.66Å | 5.6 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 6.2 |
| 4qth_AB | 111.26° | 70.26° | -51.98° | 83.39° | 123.62° | 16.07Å | 8.1 |
| 5bq7_AB | 111.83° | 72.25° | -51.73° | 84.15° | 122.88° | 16.39Å | 8.3 |
| 2w60_AB | 111.29° | 72.16° | -56.81° | 86.34° | 123.74° | 16.34Å | 8.3 |
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.3 |