Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
Crystal Structure of Dn6 TCR
Item | Info |
---|---|
PDB | 4onh |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.008Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV36/TRAJ52 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VB | B | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASRHGLASYEQY | None | 12 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHNY | None | 5 |
CDRA3 | AWAGGTSYGKLT | None | 12 |
CDRA2 | LTSSGIE | None | 7 |
CDRA1 | VTNFRS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.40° |
BC1 | 71.96° |
BA | -51.81° |
AC2 | 87.71° |
AC1 | 127.93° |
dc | 17.28Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2cde_FE | 103.80° | 70.90° | -51.77° | 85.50° | 129.72° | 17.10Å | 4.0 |
3dx9_BA | 104.77° | 70.30° | -51.98° | 90.98° | 128.49° | 17.31Å | 4.1 |
3dx9_DC | 103.97° | 70.05° | -51.49° | 90.65° | 128.47° | 17.29Å | 4.3 |
3vxu_ED | 106.29° | 69.31° | -49.40° | 85.23° | 125.93° | 17.29Å | 4.8 |
6rsy_JI | 103.21° | 72.00° | -53.93° | 91.18° | 125.77° | 16.66Å | 5.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 6.2 |
4qth_AB | 111.26° | 70.26° | -51.98° | 83.39° | 123.62° | 16.07Å | 8.1 |
5bq7_AB | 111.83° | 72.25° | -51.73° | 84.15° | 122.88° | 16.39Å | 8.3 |
2w60_AB | 111.29° | 72.16° | -56.81° | 86.34° | 123.74° | 16.34Å | 8.3 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.3 |