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Jr5.1 Protein complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4ozf |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.7Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | H |
| VA chain | G |
| VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV26/TRAJ54 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | J |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
| Antigen Sequence | APQPELPYPQPGS |
| Antigen Length | 13 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-DQA1*0501 / HLA-DQB1*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | H | FASTA file |
|
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| VA | G | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSFRALAADTQY | None | 13 |
| CDRB2 | FQGNSA | None | 6 |
| CDRB1 | SGHTA | None | 5 |
| CDRA3 | IAFQGAQKLV | None | 10 |
| CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 99.50° |
| BC1 | 73.08° |
| BA | -54.73° |
| AC2 | 99.72° |
| AC1 | 127.79° |
| dc | 17.90Å |
| Docking angle | 45.95° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6u3o_HG | 99.07° | 72.44° | -55.96° | 97.99° | 128.67° | 17.75Å | 2.4 |
| 6u3o_BA | 99.94° | 72.47° | -55.86° | 97.29° | 128.96° | 17.74Å | 3.0 |
| 4ozh_FE | 100.05° | 72.88° | -54.01° | 99.83° | 131.30° | 18.21Å | 3.6 |
| 4ozh_HG | 101.58° | 72.99° | -53.93° | 98.19° | 131.22° | 18.13Å | 4.4 |
| 4ozg_FE | 101.51° | 72.50° | -54.47° | 96.82° | 131.35° | 17.91Å | 5.1 |