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Crystal Structure of the 2B4 TCR in complex with 2a/I-Ek
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4p2o |
| Organism | MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.603Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | D |
| VA chain | C |
| VB IMGT details | TRBV26/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ56 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | ADPADPLAFFSSAIKGGGGSLV |
| Antigen Length | 22 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | mouse |
| MHC IMGT details | H2-EA / H2-EB1k |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | D | FASTA file |
|
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| VA | C | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLNWSQDTQY | None | 12 |
| CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
| CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
| CDRA3 | AALRATGGNNKLT | None | 13 |
| CDRA2 | LASGT | None | 5 |
| CDRA1 | TTMRA | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 97.65° |
| BC1 | 73.22° |
| BA | -63.70° |
| AC2 | 79.93° |
| AC1 | 120.65° |
| dc | 15.65Å |
| Docking angle | 38.81° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6bga_DC | 97.05° | 72.68° | -63.59° | 79.78° | 120.33° | 15.68Å | 0.9 |
| 7t2d_ON | 98.58° | 72.77° | -62.78° | 79.21° | 121.28° | 15.79Å | 1.7 |
| 7t2d_TS | 98.57° | 72.81° | -63.12° | 78.80° | 121.48° | 15.70Å | 1.8 |
| 7t2d_JI | 98.51° | 72.33° | -62.82° | 78.01° | 120.61° | 15.98Å | 2.5 |
| 3qib_DC | 96.76° | 72.09° | -61.86° | 81.15° | 122.15° | 16.00Å | 3.1 |