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Crystal Structure of Human TCR alpha Chain-Trav21-Traj8 and Beta Chain-Trbv7-8
Item | Info |
---|---|
PDB | 4ww1 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.38Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ8 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSSRDLEQY | None | 10 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SGHVS | None | 5 |
CDRA3 | AGVNTGFQKLV | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.90° |
BC1 | 75.53° |
BA | -54.70° |
AC2 | 79.77° |
AC1 | 119.09° |
dc | 15.46Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6r2l_ED | 100.19° | 75.35° | -54.43° | 81.77° | 120.33° | 15.96Å | 2.5 |
4ww2_BA | 102.10° | 74.86° | -55.92° | 80.68° | 120.96° | 15.48Å | 2.8 |
7nmg_ED | 101.49° | 74.29° | -55.01° | 81.27° | 120.91° | 16.16Å | 2.8 |
7nme_ED | 101.80° | 74.80° | -54.27° | 81.80° | 120.98° | 16.24Å | 3.1 |
7nmf_ED | 102.41° | 74.13° | -54.73° | 81.83° | 121.62° | 16.17Å | 3.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.7 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 9.5 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 9.9 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 10.0 |