Detailed entry information.
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S13 complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 4z7u |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.7Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ49 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | I |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | E | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSTTPGTGTETQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDRSNQFY | None | 10 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 107.76° |
BC1 | 73.67° |
BA | -57.94° |
AC2 | 88.53° |
AC1 | 131.88° |
dc | 17.47Å |
Docking angle | 36.41° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7rrg_ED | 110.74° | 73.78° | -58.09° | 86.50° | 131.23° | 16.91Å | 3.7 |
5d2n_ED | 110.19° | 72.39° | -59.01° | 86.80° | 130.58° | 17.29Å | 3.7 |
5d2n_FC | 110.14° | 72.01° | -59.58° | 87.06° | 130.65° | 17.38Å | 3.8 |
8trl_HG | 108.52° | 72.50° | -59.82° | 90.22° | 134.25° | 17.81Å | 3.8 |
7n5c_ED | 105.57° | 71.00° | -59.85° | 87.94° | 130.75° | 17.78Å | 4.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2w60_AB | 111.29° | 72.16° | -56.81° | 86.34° | 123.74° | 16.34Å | 9.4 |
4hfu_HL | 112.36° | 71.78° | -58.26° | 83.56° | 125.23° | 16.51Å | 9.7 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.9 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | H |
VA chain | G |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ49 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | J |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | H | FASTA file |
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VA | G | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSTTPGTGTETQY | None | 14 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDRSNQFY | None | 10 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 108.35° |
BC1 | 73.51° |
BA | -58.43° |
AC2 | 88.99° |
AC1 | 131.96° |
dc | 17.40Å |
Docking angle | 37.23° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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8trl_HG | 108.52° | 72.50° | -59.82° | 90.22° | 134.25° | 17.81Å | 3.1 |
5d2n_ED | 110.19° | 72.39° | -59.01° | 86.80° | 130.58° | 17.29Å | 3.4 |
5d2n_FC | 110.14° | 72.01° | -59.58° | 87.06° | 130.65° | 17.38Å | 3.5 |
7rrg_ED | 110.74° | 73.78° | -58.09° | 86.50° | 131.23° | 16.91Å | 3.6 |
3pqy_ED | 107.20° | 69.52° | -58.40° | 89.24° | 131.57° | 18.08Å | 4.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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2w60_AB | 111.29° | 72.16° | -56.81° | 86.34° | 123.74° | 16.34Å | 9.4 |
4hfu_HL | 112.36° | 71.78° | -58.26° | 83.56° | 125.23° | 16.51Å | 9.7 |
4jpw_HL | 112.65° | 71.66° | -58.66° | 89.39° | 123.36° | 16.92Å | 9.8 |