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L3-12 complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4z7v |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.65Å |
| Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | F |
| VA chain | E |
| VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV26/TRAJ54 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | I |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
| Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
| Antigen Length | 18 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | C | D |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | F | FASTA file |
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| VA | E | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSAGTSGEYEQY | None | 13 |
| CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
| CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
| CDRA3 | ILRDSRAQKLV | None | 11 |
| CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 111.26° |
| BC1 | 73.06° |
| BA | -61.69° |
| AC2 | 93.39° |
| AC1 | 131.70° |
| dc | 17.14Å |
| Docking angle | 39.67° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4gg6_HG | 110.99° | 73.29° | -63.02° | 90.06° | 131.30° | 16.97Å | 3.6 |
| 2esv_ED | 107.82° | 72.93° | -61.63° | 93.92° | 130.54° | 17.31Å | 3.7 |
| 4gg6_FE | 111.17° | 73.07° | -62.86° | 89.77° | 131.55° | 16.94Å | 3.8 |
| 3kpr_ED | 108.37° | 71.95° | -62.50° | 91.08° | 133.35° | 17.66Å | 4.3 |
| 7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 4.8 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4jpw_HL | 112.65° | 71.66° | -58.66° | 89.39° | 123.36° | 16.92Å | 9.9 |
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | H |
| VA chain | G |
| VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV26/TRAJ54 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | J |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
| Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
| Antigen Length | 18 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | H | FASTA file |
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| VA | G | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSAGTSGEYEQY | None | 13 |
| CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
| CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
| CDRA3 | ILRDSRAQKLV | None | 11 |
| CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 111.21° |
| BC1 | 73.03° |
| BA | -62.36° |
| AC2 | 92.92° |
| AC1 | 131.88° |
| dc | 17.12Å |
| Docking angle | 38.98° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4gg6_HG | 110.99° | 73.29° | -63.02° | 90.06° | 131.30° | 16.97Å | 3.0 |
| 4gg6_FE | 111.17° | 73.07° | -62.86° | 89.77° | 131.55° | 16.94Å | 3.2 |
| 3kpr_ED | 108.37° | 71.95° | -62.50° | 91.08° | 133.35° | 17.66Å | 3.9 |
| 2esv_ED | 107.82° | 72.93° | -61.63° | 93.92° | 130.54° | 17.31Å | 3.9 |
| 7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 4.7 |