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Key: Loading Structure... Display options: |
L3-12 complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 4z7v |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.65Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ54 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | I |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | E | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSAGTSGEYEQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDSRAQKLV | None | 11 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 111.26° |
BC1 | 73.06° |
BA | -61.69° |
AC2 | 93.39° |
AC1 | 131.70° |
dc | 17.14Å |
Docking angle | 39.67° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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4gg6_HG | 110.99° | 73.29° | -63.02° | 90.06° | 131.30° | 16.97Å | 3.6 |
2esv_ED | 107.82° | 72.93° | -61.63° | 93.92° | 130.54° | 17.31Å | 3.7 |
4gg6_FE | 111.17° | 73.07° | -62.86° | 89.77° | 131.55° | 16.94Å | 3.8 |
3kpr_ED | 108.37° | 71.95° | -62.50° | 91.08° | 133.35° | 17.66Å | 4.3 |
7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 4.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4jpw_HL | 112.65° | 71.66° | -58.66° | 89.39° | 123.36° | 16.92Å | 9.9 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | H |
VA chain | G |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ54 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | J |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APSGEGSFQPSQENPQGS |
Antigen Length | 18 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | H | FASTA file |
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VA | G | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSAGTSGEYEQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | ILRDSRAQKLV | None | 11 |
CDRA2 | GLTSN | None | 5 |
CDRA1 | TISGTDY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 111.21° |
BC1 | 73.03° |
BA | -62.36° |
AC2 | 92.92° |
AC1 | 131.88° |
dc | 17.12Å |
Docking angle | 38.98° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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4gg6_HG | 110.99° | 73.29° | -63.02° | 90.06° | 131.30° | 16.97Å | 3.0 |
4gg6_FE | 111.17° | 73.07° | -62.86° | 89.77° | 131.55° | 16.94Å | 3.2 |
3kpr_ED | 108.37° | 71.95° | -62.50° | 91.08° | 133.35° | 17.66Å | 3.9 |
2esv_ED | 107.82° | 72.93° | -61.63° | 93.92° | 130.54° | 17.31Å | 3.9 |
7ndt_ED | 107.81° | 73.60° | -63.54° | 93.10° | 128.98° | 17.20Å | 4.7 |