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Crystal Structure of Jka6 TCR
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 4zdh |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.0984Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV28/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV12/TRAJ24 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSFLGTGVEQY | None | 12 |
| CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
| CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
| CDRA3 | AVTTDSWGKLQ | A3-11-C | 11 |
| CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
| CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 102.75° |
| BC1 | 70.60° |
| BA | -53.65° |
| AC2 | 74.27° |
| AC1 | 126.61° |
| dc | 16.51Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2p1y_Gg | 104.08° | 69.35° | -55.78° | 73.93° | 128.57° | 17.19Å | 3.5 |
| 2p1y_Ee | 104.20° | 69.26° | -55.90° | 73.75° | 128.40° | 17.20Å | 3.6 |
| 6vm8_ED | 101.35° | 69.91° | -57.04° | 74.31° | 124.38° | 17.25Å | 4.4 |
| 6tro_ED | 101.60° | 73.22° | -56.62° | 75.68° | 125.70° | 17.35Å | 4.5 |
| 2ak4_ED | 102.11° | 71.38° | -53.33° | 76.15° | 122.60° | 16.24Å | 4.6 |