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Mage-a3 Reactive TCR in complex with Mage-a3 in HLA-A1
Item | Info |
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PDB | 5brz |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.62Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV5/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ28 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | EVDPIGHLY |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0101 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSFNMATGQY | None | 11 |
CDRB2 | YFSETQ | None | 6 |
CDRB1 | SGHRS | None | 5 |
CDRA3 | AVRPGGAGPFFVV | None | 13 |
CDRA2 | VRPYQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.38° |
BC1 | 70.91° |
BA | -46.16° |
AC2 | 86.76° |
AC1 | 123.99° |
dc | 16.21Å |
Docking angle | 57.90° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5bs0_ED | 101.94° | 71.33° | -45.62° | 87.50° | 124.02° | 16.22Å | 1.2 |
2bnr_ED | 99.46° | 70.52° | -47.45° | 87.20° | 123.24° | 16.92Å | 2.6 |
2pye_ED | 99.75° | 70.55° | -44.88° | 88.10° | 123.21° | 17.40Å | 2.9 |
2bnq_ED | 99.08° | 70.19° | -46.99° | 87.94° | 123.48° | 17.00Å | 3.0 |
2p5e_ED | 99.36° | 69.92° | -44.56° | 87.86° | 123.35° | 17.00Å | 3.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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5aum_AB | 108.02° | 70.08° | -43.21° | 85.51° | 119.94° | 16.13Å | 8.5 |
1cfn_BA | 107.76° | 67.31° | -50.48° | 85.90° | 120.10° | 16.45Å | 9.4 |
1cft_BA | 107.61° | 67.68° | -51.49° | 84.71° | 119.99° | 16.31Å | 9.9 |