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Structure of Mr1-Reactive Mav36 TCR
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 5d7k |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 1.9Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV28/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV36/TRAJ34 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSPSGYQETQY | None | 12 |
| CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
| CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
| CDRA3 | AAYNTDKLI | None | 9 |
| CDRA2 | LTSSGIE | None | 7 |
| CDRA1 | VTNFRS | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 101.16° |
| BC1 | 70.37° |
| BA | -59.20° |
| AC2 | 86.27° |
| AC1 | 126.06° |
| dc | 17.13Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3sjv_ED | 102.60° | 70.79° | -58.72° | 86.15° | 124.19° | 17.41Å | 2.5 |
| 3tzv_HG | 101.12° | 70.54° | -61.31° | 83.81° | 127.17° | 17.14Å | 3.4 |
| 3tyf_BA | 101.94° | 70.96° | -62.36° | 86.65° | 127.41° | 17.27Å | 3.6 |
| 3e3q_SR | 100.83° | 72.37° | -58.33° | 83.18° | 125.81° | 16.62Å | 3.8 |
| 2po6_DC | 100.88° | 70.51° | -60.85° | 85.02° | 129.17° | 17.22Å | 3.8 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.1 |