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Hla Class I antigen
Item | Info |
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PDB | 5eu6 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.02Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ53 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | YLEPGPVTV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSFIGGTDTQY | None | 12 |
CDRB2 | FQGTGA | None | 6 |
CDRB1 | SGHTA | None | 5 |
CDRA3 | AVLSSGGSNYKLT | None | 13 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 103.65° |
BC1 | 79.06° |
BA | -68.37° |
AC2 | 72.34° |
AC1 | 119.45° |
dc | 15.81Å |
Docking angle | 47.78° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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7sg0_ED | 102.38° | 77.02° | -65.64° | 74.45° | 120.37° | 16.11Å | 4.3 |
7n1c_ED | 104.81° | 76.16° | -67.05° | 69.82° | 119.63° | 16.39Å | 4.3 |
5hyj_ED | 107.27° | 76.96° | -68.23° | 75.03° | 121.66° | 15.75Å | 5.4 |
7n1e_ED | 107.06° | 75.28° | -66.66° | 72.24° | 118.47° | 16.43Å | 5.5 |
6v18_ED | 105.35° | 73.95° | -67.76° | 74.67° | 119.14° | 16.34Å | 5.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 6.9 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 9.4 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 9.5 |
4uim_EF | 109.02° | 71.73° | -67.38° | 75.62° | 117.23° | 16.08Å | 10.0 |