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Crystal Structure of the Jm22 TCR in complex with HLA-A*0201 in complex with M1-G4E
Item | Info |
---|---|
PDB | 5hho |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.95Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV27/TRAJ42 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | GILEFVFTL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSIRSSYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AGAGSQGNLI | A3-10-C | 10 |
CDRA2 | VVTGGEV | None | 7 |
CDRA1 | SVFSS | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.56° |
BC1 | 67.45° |
BA | -50.20° |
AC2 | 81.53° |
AC1 | 128.75° |
dc | 17.08Å |
Docking angle | 64.33° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5hhm_JI | 102.11° | 67.67° | -50.24° | 81.42° | 128.65° | 17.00Å | 0.6 |
5hhm_ED | 101.72° | 67.97° | -50.56° | 81.00° | 128.78° | 16.94Å | 0.9 |
2vlr_ED | 101.89° | 68.24° | -50.85° | 80.78° | 128.30° | 17.33Å | 1.4 |
1oga_ED | 101.63° | 66.96° | -50.54° | 80.21° | 129.12° | 17.20Å | 1.5 |
2vlr_JI | 102.60° | 68.26° | -50.48° | 80.59° | 128.66° | 17.58Å | 1.7 |