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Human 199.54-16 TCR in complex with Melan-a/Mart-1 (26-35) Peptide and HLA-A2
Item | Info |
---|---|
PDB | 5nht |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.2Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ45 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ELAGIGILTV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | H | L |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSQGLAGAGELF | None | 13 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AVGGGADGLT | None | 10 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.13° |
BC1 | 68.69° |
BA | -57.46° |
AC2 | 82.69° |
AC1 | 122.56° |
dc | 16.86Å |
Docking angle | 34.79° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5nqk_BA | 103.76° | 68.20° | -57.08° | 83.05° | 122.37° | 17.14Å | 0.9 |
7pbc_BA | 104.06° | 69.54° | -55.15° | 82.31° | 122.48° | 16.67Å | 2.5 |
4c56_HG | 103.95° | 67.01° | -55.96° | 83.39° | 124.61° | 16.20Å | 3.2 |
6rpb_ON | 103.91° | 70.36° | -56.96° | 80.73° | 124.65° | 17.02Å | 3.4 |
7n6e_HG | 102.63° | 71.19° | -56.97° | 81.44° | 123.69° | 16.62Å | 3.4 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 4.7 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 5.8 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 6.2 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 6.6 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.6 |