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a T Cell Receptor in complex with HLA-A0201 Restricted Hepatitis C Virus Ns3 Peptide (Klvalginav)
Item | Info |
---|---|
PDB | 5yxn |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.03Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV25/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV38/TRAJ30 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | I |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HEPATITIS C VIRUS |
Antigen Sequence | KLVALGINAV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASRRGPYEQY | None | 10 |
CDRB2 | SYGVNS | None | 6 |
CDRB1 | MGHDK | None | 5 |
CDRA3 | AYGEDDKII | None | 9 |
CDRA2 | QEAYKQQN | None | 8 |
CDRA1 | TSESDYY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 103.61° |
BC1 | 72.46° |
BA | -58.14° |
AC2 | 80.52° |
AC1 | 125.75° |
dc | 16.26Å |
Docking angle | 30.25° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2e7l_DA | 103.46° | 72.58° | -58.01° | 82.08° | 125.57° | 16.65Å | 1.6 |
5jzi_JI | 103.64° | 71.67° | -57.46° | 81.83° | 125.91° | 16.54Å | 1.7 |
5iw1_FE | 102.75° | 72.60° | -57.69° | 79.29° | 125.17° | 17.16Å | 1.9 |
2e7l_CB | 104.72° | 71.98° | -59.47° | 80.72° | 125.33° | 16.84Å | 1.9 |
3e3q_ED | 103.32° | 72.06° | -59.90° | 80.87° | 125.10° | 16.80Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.2 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 7.5 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.8 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.2 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.6 |