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Crystal Structure of the Kfj5 TCR
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6at6 |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 1.417Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV28/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ21 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSQRQEGDTQY | None | 12 |
| CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
| CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
| CDRA3 | LVGEILDNFNKFY | None | 13 |
| CDRA2 | GYKTK | None | 5 |
| CDRA1 | NIATNDY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 108.59° |
| BC1 | 68.53° |
| BA | -61.44° |
| AC2 | 83.47° |
| AC1 | 134.75° |
| dc | 18.18Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6avf_BA | 107.11° | 69.32° | -63.24° | 81.79° | 130.55° | 17.51Å | 5.2 |
| 7rk7_ED | 111.22° | 70.45° | -56.86° | 83.21° | 131.56° | 17.65Å | 6.5 |
| 1kgc_ED | 109.35° | 71.85° | -63.15° | 86.71° | 130.57° | 17.26Å | 6.6 |
| 5d2n_FC | 110.14° | 72.01° | -59.58° | 87.06° | 130.65° | 17.38Å | 7.0 |
| 5d2n_ED | 110.19° | 72.39° | -59.01° | 86.80° | 130.58° | 17.29Å | 7.3 |