Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
2B4 I-Ek TCR-MHC complex with affinity-Enhancing Velcro Peptide
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6bga |
| Organism | MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.307Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | D |
| VA chain | C |
| VB IMGT details | TRBV26/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ56 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | E |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | YVVVPDGTGGGSGSG |
| Antigen Length | 15 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | mouse |
| MHC IMGT details | H2-EA / H2-EB1k |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | D | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VA | C | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLNWSQDTQY | None | 12 |
| CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
| CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
| CDRA3 | AALRATGGNNKLT | None | 13 |
| CDRA2 | LASGT | None | 5 |
| CDRA1 | TTMRA | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 97.05° |
| BC1 | 72.68° |
| BA | -63.59° |
| AC2 | 79.78° |
| AC1 | 120.33° |
| dc | 15.68Å |
| Docking angle | 36.30° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4p2o_DC | 97.65° | 73.22° | -63.70° | 79.93° | 120.65° | 15.65Å | 0.9 |
| 7t2d_ON | 98.58° | 72.77° | -62.78° | 79.21° | 121.28° | 15.79Å | 2.1 |
| 7t2d_TS | 98.57° | 72.81° | -63.12° | 78.80° | 121.48° | 15.70Å | 2.2 |
| 7t2d_JI | 98.51° | 72.33° | -62.82° | 78.01° | 120.61° | 15.98Å | 2.5 |
| 3qjh_DC | 95.16° | 71.23° | -62.76° | 80.66° | 120.31° | 16.37Å | 2.8 |