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MHC-independent T-Cell Receptor B12a
Item | Info |
---|---|
PDB | 6c61 |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.43Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV26/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV6/TRAJ37 |
Species | mouse |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSPGQGAATGQLY | None | 14 |
CDRB2 | FQNQEV | None | 6 |
CDRB1 | KGHPV | None | 5 |
CDRA3 | ALGIITGNTGKLI | None | 13 |
CDRA2 | VITAGQK | None | 7 |
CDRA1 | ATSIAYPN | None | 8 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.18° |
BC1 | 74.00° |
BA | -65.29° |
AC2 | 76.32° |
AC1 | 122.94° |
dc | 17.25Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3he6_DC | 100.80° | 74.12° | -65.56° | 76.18° | 123.52° | 16.62Å | 1.1 |
3are_DC | 100.15° | 74.20° | -64.40° | 75.94° | 123.52° | 16.55Å | 1.3 |
3ard_DC | 100.72° | 74.94° | -64.96° | 76.72° | 123.07° | 16.43Å | 1.5 |
3arf_DC | 100.12° | 74.68° | -63.86° | 76.60° | 123.39° | 16.45Å | 1.9 |
3arg_DC | 100.19° | 74.42° | -63.11° | 76.38° | 122.80° | 16.67Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 8.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.3 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 9.7 |