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Mouse TCR I.29 in complex with Iag7-P8E9E6Ss
Item | Info |
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PDB | 6dfs |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV1/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV10/TRAJ53 |
Species | mouse |
Item | Info |
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MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | MH2-AAd / H2-AB-NOD |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | TCSAGLGYEQY | None | 11 |
CDRB2 | LRSPGD | B2-6-C | 6 |
CDRB1 | NSQYPW | B1-6-A | 6 |
CDRA3 | AASPSNSGGSNYKLT | None | 15 |
CDRA2 | IRSNVDR | None | 7 |
CDRA1 | DTASSY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 108.16° |
BC1 | 76.95° |
BA | -59.83° |
AC2 | 81.45° |
AC1 | 120.03° |
dc | 15.35Å |
Docking angle | 36.36° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5nmg_ED | 107.26° | 76.37° | -59.58° | 81.55° | 120.22° | 15.37Å | 1.1 |
6dfq_DC | 107.89° | 77.81° | -60.67° | 82.33° | 120.67° | 15.36Å | 1.6 |
5nme_ED | 106.95° | 76.37° | -60.59° | 80.74° | 120.38° | 15.51Å | 1.7 |
5nmg_JI | 105.93° | 75.84° | -59.97° | 82.23° | 119.89° | 15.38Å | 2.6 |
5nme_JI | 105.68° | 76.02° | -61.00° | 81.69° | 119.86° | 15.53Å | 2.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 3.4 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 4.7 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 4.7 |
1cl7_HL | 111.63° | 74.67° | -60.00° | 82.67° | 121.69° | 16.39Å | 4.8 |
2dbl_HL | 110.84° | 73.37° | -61.14° | 82.14° | 120.45° | 16.63Å | 4.9 |