Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
F11 T-Cell Receptor Recognising Pkyvkqntlklat Peptide Presented By HLA-Dr*0101
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6fr9 |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 1.62Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV24/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV8/TRAJ30 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ATSDESYGYT | None | 10 |
| CDRB2 | SFDVKD | None | 6 |
| CDRB1 | KGHDR | None | 5 |
| CDRA3 | AVSEQDDKII | A3-10-B | 10 |
| CDRA2 | YTSAATLV | A2-8-C | 8 |
| CDRA1 | SSVPPY | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 105.34° |
| BC1 | 77.72° |
| BA | -51.57° |
| AC2 | 78.78° |
| AC1 | 122.45° |
| dc | 16.33Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6eh7_BA | 105.15° | 77.73° | -51.35° | 78.62° | 122.53° | 16.27Å | 0.3 |
| 6frb_BA | 105.40° | 77.64° | -51.43° | 78.73° | 122.77° | 16.23Å | 0.4 |
| 6fum_BA | 105.03° | 77.67° | -51.12° | 78.42° | 122.57° | 16.31Å | 0.7 |
| 6fur_BA | 105.02° | 77.58° | -51.11° | 79.04° | 122.74° | 16.24Å | 0.7 |
| 6frc_BA | 105.70° | 77.45° | -51.44° | 78.36° | 122.62° | 16.30Å | 0.7 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 8.0 |
| 3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.1 |
| 1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 8.1 |
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.2 |
| 1mlc_DC | 111.18° | 74.81° | -53.86° | 82.25° | 119.71° | 16.04Å | 8.2 |