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Structure of Human T Cell Receptor-Cd3 complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6jxr |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | ELECTRON MICROSCOPY |
| Resolution | NA |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | n |
| VA chain | m |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV12/TRAJ11 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | n | FASTA file |
|
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| VA | m | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASRRRQGASGEQY | None | 13 |
| CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
| CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
| CDRA3 | AMSKGYSTLT | None | 10 |
| CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
| CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 102.17° |
| BC1 | 73.31° |
| BA | -56.70° |
| AC2 | 81.49° |
| AC1 | 124.59° |
| dc | 16.87Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7fjd_nm | 101.57° | 73.15° | -55.98° | 81.85° | 123.90° | 17.77Å | 1.5 |
| 7fje_nm | 101.49° | 74.19° | -56.40° | 81.31° | 123.46° | 17.81Å | 1.9 |
| 7fjf_nm | 101.52° | 73.55° | -56.73° | 80.90° | 123.01° | 17.79Å | 2.0 |
| 6dfx_JI | 101.90° | 71.93° | -57.72° | 82.26° | 125.04° | 16.30Å | 2.0 |
| 7n6e_JI | 103.86° | 72.36° | -56.32° | 81.13° | 124.97° | 16.31Å | 2.1 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.2 |
| 3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.0 |
| 4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 8.1 |
| 3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 8.2 |
| 4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.6 |