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5287 TCR Bound to Iab Padi4
Item | Info |
---|---|
PDB | 6mkr |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.355Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV13/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV14/TRAJ52 |
Species | mouse |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | MH2-AA / H2-AB1*01 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASGDFWGDTLY | None | 11 |
CDRB2 | SYGAGS | None | 6 |
CDRB1 | NNHNN | None | 5 |
CDRA3 | AASETGANTGKLT | None | 13 |
CDRA2 | ILSVSDK | None | 7 |
CDRA1 | NSAFDY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.96° |
BC1 | 72.53° |
BA | -64.05° |
AC2 | 76.20° |
AC1 | 126.29° |
dc | 17.13Å |
Docking angle | 40.90° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6mkd_BA | 107.20° | 71.88° | -64.03° | 76.05° | 126.43° | 17.05Å | 0.7 |
6mnm_BA | 107.37° | 72.00° | -63.62° | 77.00° | 125.68° | 16.98Å | 1.3 |
4p4k_HG | 106.28° | 71.17° | -65.08° | 76.50° | 126.10° | 16.76Å | 1.9 |
6mno_BA | 106.91° | 72.42° | -65.42° | 75.23° | 125.46° | 16.80Å | 1.9 |
6mnn_BA | 106.70° | 72.54° | -65.52° | 75.34° | 125.31° | 16.82Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.2 |
4x4x_CD | 112.33° | 72.96° | -60.80° | 78.66° | 125.88° | 15.67Å | 6.9 |
4uim_AB | 109.49° | 71.42° | -65.63° | 76.99° | 119.77° | 15.95Å | 7.4 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.5 |
4x4y_CD | 112.91° | 73.65° | -61.15° | 79.25° | 124.76° | 15.70Å | 7.7 |