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6256 TCR Bound to I-ab Padi4
Item | Info |
---|---|
PDB | 6mnm |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV13/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV14/TRAJ52 |
Species | mouse |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | MH2-AA / H2-AB1*01 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASGDFWGDTLY | None | 11 |
CDRB2 | SYGAGS | None | 6 |
CDRB1 | NNHNN | None | 5 |
CDRA3 | AASATGANTGKLT | None | 13 |
CDRA2 | IRSVSDK | None | 7 |
CDRA1 | NSAFDY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 107.37° |
BC1 | 72.00° |
BA | -63.62° |
AC2 | 77.00° |
AC1 | 125.68° |
dc | 16.98Å |
Docking angle | 42.80° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6mkd_BA | 107.20° | 71.88° | -64.03° | 76.05° | 126.43° | 17.05Å | 1.3 |
6mkr_BA | 106.96° | 72.53° | -64.05° | 76.20° | 126.29° | 17.13Å | 1.3 |
4ms8_DC | 108.26° | 71.77° | -62.08° | 77.59° | 124.79° | 16.51Å | 2.1 |
4p4k_HG | 106.28° | 71.17° | -65.08° | 76.50° | 126.10° | 16.76Å | 2.1 |
4g8f_BA | 106.37° | 71.74° | -62.87° | 78.56° | 124.53° | 16.77Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.0 |
4x4x_CD | 112.33° | 72.96° | -60.80° | 78.66° | 125.88° | 15.67Å | 6.2 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 6.4 |
4x4y_CD | 112.91° | 73.65° | -61.15° | 79.25° | 124.76° | 15.70Å | 6.9 |
2zjs_HL | 111.63° | 69.76° | -63.89° | 80.09° | 121.84° | 15.83Å | 7.0 |