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6236 TCR Bound to I-ab Padi4
Item | Info |
---|---|
PDB | 6mnn |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.83Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV13/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV14/TRAJ52 |
Species | mouse |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | mouse |
MHC IMGT details | MH2-AA / H2-AB1*01 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASGDFWGDTLY | None | 11 |
CDRB2 | SYGAGS | None | 6 |
CDRB1 | NNHNN | None | 5 |
CDRA3 | AASVTGANTGKLT | None | 13 |
CDRA2 | IRSVSDK | None | 7 |
CDRA1 | NSAFDY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.70° |
BC1 | 72.54° |
BA | -65.52° |
AC2 | 75.34° |
AC1 | 125.31° |
dc | 16.82Å |
Docking angle | 45.54° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6mno_BA | 106.91° | 72.42° | -65.42° | 75.23° | 125.46° | 16.80Å | 0.3 |
6mng_BA | 106.81° | 72.63° | -65.58° | 75.48° | 124.97° | 16.81Å | 0.4 |
4p4k_DC | 106.63° | 72.04° | -65.99° | 75.64° | 125.63° | 16.65Å | 0.8 |
4n5e_DC | 105.98° | 71.35° | -64.99° | 75.45° | 124.61° | 16.99Å | 1.7 |
6mkr_BA | 106.96° | 72.53° | -64.05° | 76.20° | 126.29° | 17.13Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.0 |
1jv5_BA | 111.45° | 73.74° | -67.77° | 74.39° | 122.07° | 15.49Å | 6.5 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 6.6 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 7.1 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.6 |