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Crystal Structure of the Unliganded Clone 2 TCR
Item | Info |
---|---|
PDB | 6ovn |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.77Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV4/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV17/TRAJ9 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSPLGREGLNTEAF | None | 15 |
CDRB2 | YSYEKL | None | 6 |
CDRB1 | MGHRA | None | 5 |
CDRA3 | ATAAVGGFKTI | None | 11 |
CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
CDRA1 | TSINN | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.95° |
BC1 | 70.15° |
BA | -62.53° |
AC2 | 80.41° |
AC1 | 124.25° |
dc | 16.00Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7zt9_ED | 103.29° | 71.54° | -62.82° | 79.46° | 124.99° | 16.64Å | 2.0 |
3skn_HG | 101.86° | 71.18° | -62.76° | 80.79° | 123.11° | 17.06Å | 2.2 |
7zt8_ED | 102.98° | 70.77° | -62.30° | 81.33° | 125.87° | 16.92Å | 2.2 |
3sjv_JI | 102.43° | 71.16° | -60.88° | 79.59° | 124.34° | 17.17Å | 2.5 |
7zt2_ED | 103.28° | 71.69° | -63.23° | 78.73° | 124.60° | 16.68Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 7.8 |
3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 8.2 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.2 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 8.3 |
5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 8.4 |