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Crystal Structure of the Unliganded Pg10 TCR
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6ovo |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.49Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV4/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV13/TRAJ8 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSQPPLGVGTDTQY | None | 15 |
| CDRB2 | YSYEKL | None | 6 |
| CDRB1 | MGHRA | None | 5 |
| CDRA3 | AASKRGFQKLV | None | 11 |
| CDRA2 | IRSNVGE | None | 7 |
| CDRA1 | DSASNY | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 103.01° |
| BC1 | 72.72° |
| BA | -64.60° |
| AC2 | 82.04° |
| AC1 | 125.37° |
| dc | 16.52Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3tyf_DC | 102.08° | 72.13° | -63.97° | 82.92° | 126.43° | 16.81Å | 1.9 |
| 4l9l_BA | 102.30° | 73.18° | -63.63° | 80.48° | 125.58° | 16.78Å | 2.0 |
| 2ypl_ED | 101.87° | 72.23° | -65.98° | 80.60° | 124.96° | 16.84Å | 2.4 |
| 3sdx_FE | 101.12° | 71.44° | -64.76° | 81.96° | 126.82° | 17.19Å | 2.8 |
| 4l8s_BA | 104.35° | 74.03° | -64.51° | 80.22° | 124.30° | 16.34Å | 2.8 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.9 |
| 4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 7.0 |
| 1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.7 |
| 5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 8.8 |
| 1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 8.9 |