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HLA-Tcr complex
Item | Info |
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PDB | 6py2 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.82543Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV11/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV9/TRAJ57 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
Antigen Sequence | APFSEQEQPVLG |
Antigen Length | 12 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0201 / HLA-DQB1*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSSGGWGGGTEAF | None | 14 |
CDRB2 | FQNNGV | None | 6 |
CDRB1 | SGHAT | None | 5 |
CDRA3 | ASPQGGSEKLV | None | 11 |
CDRA2 | ATKADDK | None | 7 |
CDRA1 | ATGYPS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.09° |
BC1 | 73.09° |
BA | -52.34° |
AC2 | 79.71° |
AC1 | 126.93° |
dc | 16.77Å |
Docking angle | 53.94° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5w1v_ED | 105.20° | 72.49° | -55.24° | 79.52° | 127.72° | 16.57Å | 3.2 |
1zgl_RQ | 106.44° | 74.39° | -54.18° | 81.09° | 125.15° | 16.57Å | 3.2 |
5w1v_ON | 105.57° | 70.97° | -53.68° | 78.48° | 128.99° | 16.89Å | 3.5 |
1zgl_TS | 106.02° | 74.36° | -54.43° | 81.32° | 124.92° | 16.43Å | 3.6 |
1nfd_BA | 102.62° | 72.94° | -51.39° | 79.73° | 127.94° | 16.91Å | 3.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 5.8 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.5 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 6.7 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.2 |
4qth_AB | 111.26° | 70.26° | -51.98° | 83.39° | 123.62° | 16.07Å | 7.7 |