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HLA-Tcr complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6py2 |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.82543Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV11/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV9/TRAJ57 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | TRITICUM AESTIVUM |
| Antigen Sequence | APFSEQEQPVLG |
| Antigen Length | 12 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH2 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-DQA1*0201 / HLA-DQB1*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSSGGWGGGTEAF | None | 14 |
| CDRB2 | FQNNGV | None | 6 |
| CDRB1 | SGHAT | None | 5 |
| CDRA3 | ASPQGGSEKLV | None | 11 |
| CDRA2 | ATKADDK | None | 7 |
| CDRA1 | ATGYPS | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 106.09° |
| BC1 | 73.09° |
| BA | -52.34° |
| AC2 | 79.71° |
| AC1 | 126.93° |
| dc | 16.77Å |
| Docking angle | 53.94° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5w1v_ED | 105.20° | 72.49° | -55.24° | 79.52° | 127.72° | 16.57Å | 3.2 |
| 1zgl_RQ | 106.44° | 74.39° | -54.18° | 81.09° | 125.15° | 16.57Å | 3.2 |
| 5w1v_ON | 105.57° | 70.97° | -53.68° | 78.48° | 128.99° | 16.89Å | 3.5 |
| 1zgl_TS | 106.02° | 74.36° | -54.43° | 81.32° | 124.92° | 16.43Å | 3.6 |
| 1nfd_BA | 102.62° | 72.94° | -51.39° | 79.73° | 127.94° | 16.91Å | 3.7 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 5.8 |
| 3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.5 |
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 6.7 |
| 4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.2 |
| 4qth_AB | 111.26° | 70.26° | -51.98° | 83.39° | 123.62° | 16.07Å | 7.7 |