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Crystal Structure of the T-Cell Receptor Nye_S2 Bound to Hla a2*01-Sllmwitqv
Item | Info |
---|---|
PDB | 6rpa |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.56Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV29/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV3/TRAJ28 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | SLLMWITQV |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | SVGGSGGADTQY | None | 12 |
CDRB2 | ANQGSEA | None | 7 |
CDRB1 | SQVTM | None | 5 |
CDRA3 | AVRDINSGAGSYQLT | None | 15 |
CDRA2 | YITGDNLV | None | 8 |
CDRA1 | VSGNPY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.31° |
BC1 | 73.31° |
BA | -58.15° |
AC2 | 80.86° |
AC1 | 127.64° |
dc | 17.41Å |
Docking angle | 73.25° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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5jzi_ED | 102.19° | 72.02° | -56.92° | 81.33° | 126.33° | 16.63Å | 2.4 |
5yxn_BA | 103.61° | 72.46° | -58.14° | 80.52° | 125.75° | 16.26Å | 2.7 |
2e7l_DA | 103.46° | 72.58° | -58.01° | 82.08° | 125.57° | 16.65Å | 2.9 |
2eyt_BA | 104.12° | 72.35° | -58.29° | 81.38° | 129.49° | 16.87Å | 2.9 |
4qrp_ED | 101.66° | 74.29° | -56.57° | 79.64° | 125.83° | 16.91Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 9.2 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 9.5 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 9.7 |