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Structure Determination of an Enhanced affinity TCR, a24B17, in complex with HLA-A*02:01 Presenting a Mart-1 Peptide, Eaagigiltv
Item | Info |
---|---|
PDB | 6tmo |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV30/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ5 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | EAAGIGILTV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AWSETGLGMGGWQ | None | 13 |
CDRB2 | WGPFG | None | 5 |
CDRB1 | GTSNPN | None | 6 |
CDRA3 | AVNDGGRLT | None | 9 |
CDRA2 | TYREGD | None | 6 |
CDRA1 | FLGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.72° |
BC1 | 75.28° |
BA | -56.86° |
AC2 | 83.49° |
AC1 | 121.07° |
dc | 15.58Å |
Docking angle | 43.38° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4jfe_ED | 101.11° | 74.96° | -56.38° | 83.55° | 120.68° | 15.65Å | 0.8 |
6eqb_ED | 101.41° | 75.30° | -56.94° | 83.40° | 120.47° | 15.56Å | 0.9 |
4jff_ED | 100.97° | 74.58° | -56.50° | 83.52° | 121.39° | 15.61Å | 0.9 |
4jfd_ED | 100.82° | 74.44° | -56.42° | 83.45° | 121.04° | 15.72Å | 1.0 |
8gvg_BA | 100.75° | 74.24° | -56.89° | 83.92° | 122.48° | 15.74Å | 1.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.5 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 9.5 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 9.6 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 9.9 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 10.0 |