Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
Crystal Structure of the T-Cell Receptor Gvy01 Bound to Hla a2*01-Gvydgrehtv
Item | Info |
---|---|
PDB | 6tro |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV28/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV10/TRAJ6 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GVYDGREHTV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VB | E | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSFLMTSGDPYEQY | None | 15 |
CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
CDRA3 | VVNHSGGSYIPT | None | 12 |
CDRA2 | MTFSENT | None | 7 |
CDRA1 | VSPFSN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.60° |
BC1 | 73.22° |
BA | -56.62° |
AC2 | 75.68° |
AC1 | 125.70° |
dc | 17.35Å |
Docking angle | 58.87° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7pb2_ED | 103.19° | 73.44° | -57.08° | 77.02° | 125.99° | 16.87Å | 2.2 |
7pb2_JI | 103.13° | 73.39° | -57.79° | 76.91° | 125.64° | 16.86Å | 2.3 |
3qdm_ED | 102.30° | 71.90° | -57.58° | 76.51° | 124.15° | 16.66Å | 2.6 |
7ea6_ED | 102.04° | 74.95° | -55.85° | 77.35° | 124.96° | 16.22Å | 2.9 |
7ea6_BA | 102.15° | 75.20° | -54.88° | 77.43° | 125.68° | 16.05Å | 3.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 9.6 |