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Crystal Structure of the T-Cell Receptor Gvy01 Bound to Hla a2*01-Gvydgrehtv
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6tro |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 3Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV28/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV10/TRAJ6 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | GVYDGREHTV |
| Antigen Length | 10 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSFLMTSGDPYEQY | None | 15 |
| CDRB2 | SYDVKM | None | 6 |
| CDRB1 | MDHEN | None | 5 |
| CDRA3 | VVNHSGGSYIPT | None | 12 |
| CDRA2 | MTFSENT | None | 7 |
| CDRA1 | VSPFSN | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 101.60° |
| BC1 | 73.22° |
| BA | -56.62° |
| AC2 | 75.68° |
| AC1 | 125.70° |
| dc | 17.35Å |
| Docking angle | 58.87° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7pb2_ED | 103.19° | 73.44° | -57.08° | 77.02° | 125.99° | 16.87Å | 2.2 |
| 7pb2_JI | 103.13° | 73.39° | -57.79° | 76.91° | 125.64° | 16.86Å | 2.3 |
| 3qdm_ED | 102.30° | 71.90° | -57.58° | 76.51° | 124.15° | 16.66Å | 2.6 |
| 7ea6_ED | 102.04° | 74.95° | -55.85° | 77.35° | 124.96° | 16.22Å | 2.9 |
| 7ea6_BA | 102.15° | 75.20° | -54.88° | 77.43° | 125.68° | 16.05Å | 3.5 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 9.6 |