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Immune Receptor complex
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 6v0y |
| Organism | MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.7Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV4/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV6/TRAJ11 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | GGYRARPAKAAAT |
| Antigen Length | 13 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | B | NA |
| MHC Type | GB |
| MHC Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLDWGGQNTLY | None | 13 |
| CDRB2 | YNNKQL | None | 6 |
| CDRB1 | LGHDT | None | 5 |
| CDRA3 | ALSDSGSFNKLT | None | 12 |
| CDRA2 | VITAGQK | None | 7 |
| CDRA1 | ATSIAYPN | None | 8 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 104.44° |
| BC1 | 74.25° |
| BA | -66.45° |
| AC2 | 75.16° |
| AC1 | 118.10° |
| dc | 16.73Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6v1a_ED | 105.38° | 74.47° | -66.72° | 75.16° | 119.27° | 16.59Å | 1.5 |
| 6v19_ED | 105.65° | 74.64° | -66.44° | 75.45° | 119.48° | 16.51Å | 1.9 |
| 6v18_ED | 105.35° | 73.95° | -67.76° | 74.67° | 119.14° | 16.34Å | 2.0 |
| 6cqq_ED | 103.95° | 73.31° | -66.36° | 76.21° | 120.82° | 15.91Å | 3.2 |
| 8cx4_FD | 104.29° | 75.46° | -65.22° | 77.54° | 119.22° | 15.63Å | 3.3 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 4.7 |
| 4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.5 |
| 4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 6.0 |
| 1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 6.8 |
| 4uin_HL | 107.61° | 70.78° | -70.27° | 77.14° | 115.22° | 16.35Å | 7.0 |