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Immune Receptor complex
Item | Info |
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PDB | 6v15 |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.8Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV4/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV6/TRAJ34 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GGYRARPAKAAAT |
Antigen Length | 13 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DRA*0101 / HLA-DRB1*0401 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLDWGVNTLY | None | 12 |
CDRB2 | YNNKQL | None | 6 |
CDRB1 | LGHDT | None | 5 |
CDRA3 | ALSPSNTNKVV | None | 11 |
CDRA2 | VPKANEK | None | 7 |
CDRA1 | TKQYPT | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 106.35° |
BC1 | 73.80° |
BA | -66.28° |
AC2 | 73.55° |
AC1 | 124.64° |
dc | 16.63Å |
Docking angle | 25.39° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6v13_ED | 106.65° | 74.00° | -66.07° | 74.03° | 124.56° | 16.59Å | 0.6 |
2uwe_ML | 108.04° | 73.37° | -66.20° | 73.74° | 124.87° | 16.70Å | 1.8 |
2j8u_ML | 107.93° | 72.98° | -66.36° | 73.99° | 124.42° | 16.81Å | 1.9 |
2z31_BA | 107.66° | 72.97° | -66.65° | 73.04° | 123.84° | 16.30Å | 1.9 |
1lp9_ML | 108.14° | 73.36° | -66.36° | 74.25° | 124.79° | 16.60Å | 2.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 4.9 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 5.4 |
1jv5_BA | 111.45° | 73.74° | -67.77° | 74.39° | 122.07° | 15.49Å | 6.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 6.7 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 8.5 |