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Immune Receptor complex
Item | Info |
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PDB | 6v1a |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.29Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV4/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV6/TRAJ50 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GGYRARPAKAAAT |
Antigen Length | 13 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DRA*0101 / HLA-DRB1*0401 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLDWASQNTLY | None | 13 |
CDRB2 | YNNKQL | None | 6 |
CDRB1 | LGHDT | None | 5 |
CDRA3 | ALSDSSSFSKLV | None | 12 |
CDRA2 | VITAGQK | None | 7 |
CDRA1 | ATSIAYPN | None | 8 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.38° |
BC1 | 74.47° |
BA | -66.72° |
AC2 | 75.16° |
AC1 | 119.27° |
dc | 16.59Å |
Docking angle | 24.85° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6v19_ED | 105.65° | 74.64° | -66.44° | 75.45° | 119.48° | 16.51Å | 0.6 |
6v18_ED | 105.35° | 73.95° | -67.76° | 74.67° | 119.14° | 16.34Å | 1.3 |
6v0y_ED | 104.44° | 74.25° | -66.45° | 75.16° | 118.10° | 16.73Å | 1.5 |
6cqq_ED | 103.95° | 73.31° | -66.36° | 76.21° | 120.82° | 15.91Å | 2.7 |
6cql_ED | 104.19° | 73.11° | -65.98° | 77.00° | 120.74° | 15.97Å | 3.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 4.2 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 4.8 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 5.5 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 5.7 |
12e8_HL | 106.48° | 69.23° | -70.96° | 74.63° | 118.60° | 16.05Å | 6.9 |