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T4H2 T Cell Receptor Bound to HLA-A2 Presenting Gp100T2L Peptide (Ildqvpfsv)
Item | Info |
---|---|
PDB | 6vmc |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.85Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ49 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSMGGTYEQY | None | 11 |
CDRB2 | SQIVND | None | 6 |
CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
CDRA3 | AVNALLGNQFY | None | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 100.88° |
BC1 | 70.42° |
BA | -52.90° |
AC2 | 80.33° |
AC1 | 126.96° |
dc | 17.14Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6vma_ED | 100.95° | 70.51° | -52.18° | 80.98° | 126.53° | 17.19Å | 1.1 |
6vm9_ED | 101.11° | 71.23° | -53.89° | 80.26° | 126.06° | 16.94Å | 1.6 |
7amq_BA | 100.33° | 71.59° | -54.33° | 80.53° | 125.07° | 16.75Å | 2.7 |
1qsf_ED | 100.59° | 70.43° | -53.95° | 81.96° | 125.01° | 16.83Å | 2.8 |
1qse_ED | 100.14° | 70.59° | -54.40° | 82.15° | 125.25° | 17.00Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.7 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 9.4 |
1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 9.9 |