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P53-Specific T Cell Receptor
Item | Info |
---|---|
PDB | 6vth |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.36Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ13 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSEGLWQVGDEQY | None | 14 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
CDRA3 | VVQPGGYQKVT | None | 11 |
CDRA2 | VYSSG | None | 5 |
CDRA1 | NSASQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.74° |
BC1 | 71.64° |
BA | -57.94° |
AC2 | 81.95° |
AC1 | 125.13° |
dc | 17.18Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6dfx_JI | 101.90° | 71.93° | -57.72° | 82.26° | 125.04° | 16.30Å | 1.3 |
6vrm_ED | 103.62° | 72.56° | -58.21° | 82.07° | 124.91° | 17.13Å | 1.3 |
5jzi_JI | 103.64° | 71.67° | -57.46° | 81.83° | 125.91° | 16.54Å | 1.4 |
2e7l_DA | 103.46° | 72.58° | -58.01° | 82.08° | 125.57° | 16.65Å | 1.4 |
5jzi_ED | 102.19° | 72.02° | -56.92° | 81.33° | 126.33° | 16.63Å | 1.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.4 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 8.1 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.1 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.2 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 8.2 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ13 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
|
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSEGLWQVGDEQY | None | 14 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNS | None | 5 |
CDRA3 | VVQPGGYQKVT | None | 11 |
CDRA2 | VYSSG | None | 5 |
CDRA1 | NSASQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.44° |
BC1 | 71.68° |
BA | -55.01° |
AC2 | 83.15° |
AC1 | 126.50° |
dc | 17.31Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5jzi_ED | 102.19° | 72.02° | -56.92° | 81.33° | 126.33° | 16.63Å | 2.8 |
7amp_BA | 100.35° | 72.19° | -53.62° | 82.36° | 125.70° | 17.13Å | 2.8 |
5fk9_BA | 104.25° | 70.45° | -53.74° | 83.05° | 125.59° | 16.11Å | 2.9 |
5yxu_BA | 103.19° | 70.02° | -55.97° | 81.28° | 127.13° | 16.34Å | 3.0 |
8tfn_BA | 100.45° | 70.20° | -55.86° | 83.24° | 125.21° | 16.87Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.1 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 7.6 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.0 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 8.4 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 9.3 |