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Crystal Structure of inha:01 TCR in complex with HLA-E (F116C) Bound to inha (53-61 H4C)
Item | Info |
---|---|
PDB | 6zkz |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ15 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS H37RV |
Antigen Sequence | RLPAKAPLL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-E*0103 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSYSIRGSRGEQF | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTNQAGTALI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.83° |
BC1 | 69.43° |
BA | -57.13° |
AC2 | 74.09° |
AC1 | 120.53° |
dc | 16.35Å |
Docking angle | 59.57° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6zkx_ED | 104.13° | 69.40° | -56.91° | 73.89° | 121.16° | 16.57Å | 0.8 |
6zkw_ED | 103.08° | 69.33° | -56.66° | 75.38° | 120.94° | 16.63Å | 1.6 |
6zky_ED | 102.45° | 69.15° | -57.45° | 75.09° | 120.34° | 16.56Å | 1.8 |
3qdj_ED | 105.56° | 69.36° | -56.86° | 77.81° | 120.75° | 16.13Å | 4.1 |
6d78_ED | 106.84° | 69.27° | -58.19° | 76.84° | 120.60° | 16.00Å | 4.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 7.7 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 8.2 |
5kte_HL | 112.24° | 69.79° | -60.09° | 77.74° | 119.92° | 16.52Å | 9.7 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 10.0 |