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Cryo-Em Structure of a Membrane Protein(Wt)
Item | Info |
---|---|
PDB | 7fjd |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | ELECTRON MICROSCOPY |
Resolution | NA |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | n |
VA chain | m |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ11 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | n | FASTA file |
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VA | m | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASRRRQGASGEQY | None | 13 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AMSKGYSTLT | None | 10 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.57° |
BC1 | 73.15° |
BA | -55.98° |
AC2 | 81.85° |
AC1 | 123.90° |
dc | 17.77Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7fje_nm | 101.49° | 74.19° | -56.40° | 81.31° | 123.46° | 17.81Å | 1.3 |
6jxr_nm | 102.17° | 73.31° | -56.70° | 81.49° | 124.59° | 16.87Å | 1.5 |
7fjf_nm | 101.52° | 73.55° | -56.73° | 80.90° | 123.01° | 17.79Å | 1.6 |
7amr_BA | 100.70° | 72.13° | -55.83° | 80.70° | 124.34° | 16.62Å | 2.2 |
7n6e_HG | 102.63° | 71.19° | -56.97° | 81.44° | 123.69° | 16.62Å | 2.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.1 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.0 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.7 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 8.8 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 8.8 |