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Cryo-Em Structure of a Membrane Protein(Cs)
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7fjf |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | ELECTRON MICROSCOPY |
| Resolution | NA |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | n |
| VA chain | m |
| VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV12/TRAJ11 |
| Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | n | FASTA file |
|
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| VA | m | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASRRRQGASGEQY | None | 13 |
| CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
| CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
| CDRA3 | AMSKGYSTLT | None | 10 |
| CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
| CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 101.52° |
| BC1 | 73.55° |
| BA | -56.73° |
| AC2 | 80.90° |
| AC1 | 123.01° |
| dc | 17.79Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7fje_nm | 101.49° | 74.19° | -56.40° | 81.31° | 123.46° | 17.81Å | 0.9 |
| 7fjd_nm | 101.57° | 73.15° | -55.98° | 81.85° | 123.90° | 17.77Å | 1.6 |
| 6jxr_nm | 102.17° | 73.31° | -56.70° | 81.49° | 124.59° | 16.87Å | 2.0 |
| 7amr_BA | 100.70° | 72.13° | -55.83° | 80.70° | 124.34° | 16.62Å | 2.6 |
| 4udu_BA | 102.41° | 72.02° | -57.03° | 81.05° | 122.79° | 15.65Å | 2.8 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.5 |
| 3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.3 |
| 4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 8.5 |
| 3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 8.8 |
| 1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 8.9 |