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Sars-Cov-2 Rlq Peptide-Specific TCR Prlq3
Item | Info |
---|---|
PDB | 7n1c |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 1.881Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV11/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV16/TRAJ39 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLGGAGGADTQY | None | 14 |
CDRB2 | FQNNGV | None | 6 |
CDRB1 | SGHAT | None | 5 |
CDRA3 | ALSGFNNAGNMLT | None | 13 |
CDRA2 | HISR | None | 4 |
CDRA1 | YSGSPE | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.81° |
BC1 | 76.16° |
BA | -67.05° |
AC2 | 69.82° |
AC1 | 119.63° |
dc | 16.39Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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7n1e_ED | 107.06° | 75.28° | -66.66° | 72.24° | 118.47° | 16.43Å | 3.6 |
5eu6_ED | 103.65° | 79.06° | -68.37° | 72.34° | 119.45° | 15.81Å | 4.3 |
6v18_ED | 105.35° | 73.95° | -67.76° | 74.67° | 119.14° | 16.34Å | 5.4 |
7sg0_ED | 102.38° | 77.02° | -65.64° | 74.45° | 120.37° | 16.11Å | 5.5 |
7z50_EH | 106.95° | 71.59° | -65.13° | 71.24° | 120.51° | 15.93Å | 5.7 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 5.8 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.6 |
1jv5_BA | 111.45° | 73.74° | -67.77° | 74.39° | 122.07° | 15.49Å | 8.8 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 9.0 |