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as4.2-Yeih-Hla*B27
Item | Info |
---|---|
PDB | 7n2o |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ22 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | LRVMMLAPF |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSVGLFSTDTQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | AVLSPVQETSGSRLT | None | 15 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.34° |
BC1 | 74.73° |
BA | -64.81° |
AC2 | 77.13° |
AC1 | 120.85° |
dc | 15.94Å |
Docking angle | 21.06° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7n2r_FD | 106.69° | 73.45° | -65.69° | 76.71° | 121.10° | 15.81Å | 1.7 |
7n2n_FD | 105.58° | 75.18° | -63.42° | 77.58° | 119.77° | 15.95Å | 2.0 |
7n2q_FD | 106.86° | 75.26° | -63.31° | 78.46° | 119.87° | 15.74Å | 2.4 |
7n2p_FD | 107.08° | 72.98° | -65.93° | 76.83° | 121.72° | 15.83Å | 2.4 |
7n2s_FD | 105.79° | 75.67° | -63.01° | 76.83° | 119.55° | 15.81Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 4.9 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 5.2 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 5.7 |
3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.1 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 6.2 |