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as3.1-Prpf3-Hla*B27
Item | Info |
---|---|
PDB | 7n2s |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.37Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ28 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | TRLALIAPK |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSVGLYSTDTQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | AVSLGTGAGSYQLT | None | 14 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.79° |
BC1 | 75.67° |
BA | -63.01° |
AC2 | 76.83° |
AC1 | 119.55° |
dc | 15.81Å |
Docking angle | 22.50° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7n2n_FD | 105.58° | 75.18° | -63.42° | 77.58° | 119.77° | 15.95Å | 1.0 |
7n2q_FD | 106.86° | 75.26° | -63.31° | 78.46° | 119.87° | 15.74Å | 2.0 |
7n2o_FD | 106.34° | 74.73° | -64.81° | 77.13° | 120.85° | 15.94Å | 2.5 |
7n2q_GE | 106.59° | 76.10° | -61.16° | 78.55° | 120.08° | 15.80Å | 2.7 |
8cx4_FD | 104.29° | 75.46° | -65.22° | 77.54° | 119.22° | 15.63Å | 2.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.9 |
5f9w_HL | 110.50° | 73.01° | -61.98° | 80.06° | 118.29° | 16.39Å | 6.5 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 6.8 |
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 6.8 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 6.9 |