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6218 TCR in complex with H2-Db Pa 224
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7n4k |
| Organism | CHIMERIC HOMO SAPIENS/MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 1.85Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV29/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV21/TRAJ53 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | INFLUENZA A VIRUS |
| Antigen Sequence | SSLENFRAYV |
| Antigen Length | 10 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | NA |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | mouse |
| MHC IMGT details | H2-D1b |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSFGREQY | None | 9 |
| CDRB2 | SYDVDS | None | 6 |
| CDRB1 | MSHET | None | 5 |
| CDRA3 | ILSGGSNYKLT | None | 11 |
| CDRA2 | GLQQN | None | 5 |
| CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 105.07° |
| BC1 | 69.54° |
| BA | -58.83° |
| AC2 | 91.75° |
| AC1 | 131.98° |
| dc | 18.15Å |
| Docking angle | 41.47° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7n5p_ED | 104.77° | 69.71° | -58.12° | 91.83° | 131.57° | 18.06Å | 0.9 |
| 3pqy_TS | 105.91° | 69.89° | -57.66° | 90.05° | 131.38° | 18.13Å | 2.3 |
| 3pqy_ED | 107.20° | 69.52° | -58.40° | 89.24° | 131.57° | 18.08Å | 3.3 |
| 3pqy_ON | 107.82° | 69.20° | -57.40° | 90.47° | 131.73° | 18.14Å | 3.4 |
| 3pqy_JI | 107.68° | 69.73° | -56.20° | 90.17° | 132.20° | 18.07Å | 4.0 |