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Gag:02 TCR in complex with HLA-E.
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7ndq |
| Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 2.551Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV7/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV4/TRAJ23 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
| Antigen Sequence | RMYSPVSIL |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | A | B |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-E*0103 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLGREYGYT | None | 11 |
| CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
| CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
| CDRA3 | LVGSSFNQGGKLI | None | 13 |
| CDRA2 | GYKTK | None | 5 |
| CDRA1 | NIATNDY | None | 7 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 108.48° |
| BC1 | 75.73° |
| BA | -66.33° |
| AC2 | 83.23° |
| AC1 | 130.91° |
| dc | 17.20Å |
| Docking angle | 77.52° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ndu_ED | 108.96° | 74.94° | -65.93° | 83.32° | 131.18° | 17.15Å | 1.0 |
| 3kpr_JI | 108.88° | 73.13° | -69.22° | 86.90° | 130.46° | 17.11Å | 5.4 |
| 6avg_EB | 110.19° | 75.14° | -63.26° | 87.61° | 129.09° | 16.95Å | 5.9 |
| 1mi5_ED | 109.30° | 72.73° | -63.43° | 87.70° | 131.17° | 17.09Å | 6.2 |
| 1kgc_ED | 109.35° | 71.85° | -63.15° | 86.71° | 130.57° | 17.26Å | 6.2 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3u7w_HL | 113.46° | 76.72° | -63.02° | 80.79° | 126.51° | 15.15Å | 8.1 |
| 4jdt_HL | 114.66° | 75.61° | -62.65° | 80.39° | 126.06° | 15.36Å | 9.3 |
| 4olw_HL | 114.43° | 76.42° | -62.67° | 79.88° | 126.11° | 15.24Å | 9.3 |
| 4olu_HL | 114.69° | 76.70° | -61.58° | 81.18° | 126.60° | 15.29Å | 9.4 |
| 4olx_HL | 114.28° | 76.79° | -61.98° | 80.35° | 126.04° | 15.18Å | 9.5 |