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Crystal Structure of Engineered TCR (796) complexed to HLA-A*02:01 Presenting Mage-a10 9-Mer Peptide
Item | Info |
---|---|
PDB | 7pbc |
Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.04Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ5 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | E |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | SYNTHETIC CONSTRUCT |
Antigen Sequence | GLYDGMEHL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | C | D |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSFTDTQY | None | 9 |
CDRB2 | SVGEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHDY | None | 5 |
CDRA3 | AVRGTGRRALT | None | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.06° |
BC1 | 69.54° |
BA | -55.15° |
AC2 | 82.31° |
AC1 | 122.48° |
dc | 16.67Å |
Docking angle | 28.86° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5nht_BA | 104.13° | 68.69° | -57.46° | 82.69° | 122.56° | 16.86Å | 2.5 |
5nqk_BA | 103.76° | 68.20° | -57.08° | 83.05° | 122.37° | 17.14Å | 2.5 |
6dkp_ED | 105.14° | 69.86° | -53.18° | 81.23° | 121.48° | 16.13Å | 2.8 |
7pdw_BA | 105.93° | 70.35° | -55.27° | 79.94° | 122.76° | 16.58Å | 3.1 |
7n6e_HG | 102.63° | 71.19° | -56.97° | 81.44° | 123.69° | 16.62Å | 3.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 4.1 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 5.0 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 5.1 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 5.7 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 6.1 |